于是明军便派出数艘船只开始向敌船靠拢，准备跳帮作战。

终于，福建水军的士卒率先登上敌船，跳上敌船与贼寇进行白刃战，这时候明军的卫所兵还是有战斗力的，与海盗、倭寇们近战拼杀也不落下风，在激战之中敌人落水者不计其数，最终，该船被明军擒获。

此战，明军生擒真倭二人、中国海盗五十三人，其中据信是吴家豢养的武装家丁十九人，阵斩倭寇服色者十七人、汉家衣冠者四十八人。

还缴获了旧式碗口铳两支、火门枪五杆、藤牌二十三面、倭刀十四把、长枪六十杆以及战鼓、旗帜等物若干。

首战告捷，虽然斩获数量不大，但是令士卒们士气大振。

将士们都自告奋勇，表示要攻入双屿，与倭寇决一死战。何忠知道将士们急于求战，好早点回家，便严令诸军沉住气，先围而不打，反正这时候最急的应该是倭寇。

果然几天之后，从双屿港中突出来两条小船，不出意外是倭寇派出的试探，明军便也派出几条小船前去迎敌。

明军中有个小旗官名叫李晃的，善使火铳，他命人拿来火绳枪，装填完毕，抵近后瞄准诱敌的小船，一枪命中一人，那人应声倒下，生死不明。

船上其余明军纷纷激动地大喊，“节级好准头！”

这一枪应该是打中了的，因为倭寇派出的那两艘小船来了个180°大转弯，拼命逃回了双屿，然后一连两天，再也没人敢出港。

明军便继续围困，双屿港也是一连几天毫无动静。

到了围困的第七日，早上寅牌时分，此时天将亮未亮，正是将士们睡得最死的时候。

双屿港中突然一股脑冲出了上百艘船只，何忠连忙传令明军各战船出击。

顿时各路官兵奋勇夹击，俘斩溺敌达数百人。

明军趁机攻上双屿岛，擒获多名倭寇小头目以及吴家家主的几个儿子。