驾驶员们再次出动，前往各个能量漩涡地点进行调查。当他们到达一个能量漩涡附近时，发现这里的磁场异常强大，EVA机体的行动受到了很大限制。

“大家小心，这里有古怪。”哆啦A梦提醒道。

突然，从能量漩涡中射出几道光线，光线击中了周围的建筑物，建筑物开始出现崩塌的迹象。

“我们得先把能量漩涡稳定住，不然城市会遭受更大的破坏。”真嗣说道。

他们尝试用EVA机体的能量系统来中和能量漩涡的能量，但效果甚微。

“这样不行，我们得找到能量漩涡的核心。”渚薰说道。

经过一番搜索，他们发现能量漩涡的核心是一个小型的装置，这个装置被一层强大的能量护盾保护着。

“我们要打破这个护盾才能破坏核心。”胖虎说道。

“大家一起攻击，集中力量！”大雄喊道。

众人齐心协力，朝着能量护盾发动攻击，在连续的攻击下，护盾开始出现裂痕。

“再加把劲！”静香喊道。

最终，护盾被打破，他们成功摧毁了能量漩涡的核心，周围的干扰信号也随之消失。

“我们成功了！”胖虎高兴地欢呼。

“别高兴得太早，还有其他的能量漩涡呢。”哆啦A梦提醒道。

他们继续前往其他能量漩涡地点，重复着之前的操作。在这个过程中，他们发现这些能量漩涡似乎是按照某种特定的规律分布的，像是在构建一个巨大的能量网络。

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“这些能量漩涡可能是一个更大阴谋的一部分，我们得尽快搞清楚。”大雄说道。

当他们解决完所有的能量漩涡后，回到总部，却发现之前被关押的神秘身影已经消失不见，只留下了一些奇怪的符号在审讯室的墙壁上。

“这是怎么回事？他们怎么逃走的？”胖虎气愤地说。

“这些符号是什么意思？”静香看着墙壁上的符号问道。

哆啦A梦仔细观察着符号，然后从四次元口袋里拿出一个符号解读器。经过分析，解读器显示这些符号是一种古老的密码，和之前加密文件中的部分内容相似。

“看来这些神秘身影是想给我们传递某种信息，或者是在嘲笑我们。”哆啦A梦说道。

“不管是哪种情况，我们不能被他们牵着鼻子走，我们要加快破解加密文件的进度，找出他们背后的秘密。”大雄坚定地说。

在大家努力破解加密文件的同时，大雄又一次尝试和EVA机体进行深度融合，希望能从之前看到的模糊画面中找到更多线索。在融合过程中，那些画面变得更加清晰，他看到了那个巨大实验室里有一些穿着白大褂的人在操作着仪器，还有一些巨大的容器，容器里似乎装着和使徒类似的生物。

融合结束后，大雄立刻把他看到的情况告诉了大家。

“这听起来像是一个实验基地，难道使徒是从那里制造出来的？”胖虎惊讶地说。

“有这种可能，而且那些神秘身影可能也和这个实验基地有关。”哆啦A梦说道。

“我们得找到这个实验室的位置，也许那里有我们想要的答案。”静香说道。

他们把这个新发现告诉了碇司令，碇司令决定派出侦查小队，利用大雄提供的画面信息在城市周边进行搜索。